肠道中的新发现:很有意义的冰山一角

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肠道中的新发现:很有意义的冰山一角

图片:Milosz1 / CC BY

继胃肠道微生物组,又发现肠道「病毒组」有什么意义?

陈星,生物数据搬砖工

就单独看这则新闻的话,确实很高上大也很有价值,科学家们发现了一种使用天然病毒来治疗某些肠道疾病的方法。

但是仔细看看学术期刊中所报告的问题本身,其实只是发现了一种病毒(MNV)可以帮助 germ-free 的小鼠部分恢复肠道的表层细胞功能,可以部分替代肠道菌群的功能。这么说,实际意义也是很大的,但是在新闻报道中的意义就过于夸张了。

新闻界总是想搞出点大新闻来。

然而,科学是严谨的,定理或者经验规则必须适用于一定的条件和一定的对象。

因此,所有摆脱语境的宣传都是耍流氓的。

这个图是对这个文章的最好说明。a 是正常情况,肠道细胞长得很好,肠道内部的免疫很不错,肠道外面的细菌群和病毒也很丰富。b 是一种无法着生细菌的小鼠的肠道,绒毛细胞表面没有细菌着生,细胞形态发育很差,免疫基本没有,一旦外界其他有害菌群入侵,将有很大麻烦。c 是用 MNV 感染无菌群的抗生素处理后(肠道有损伤)小鼠肠道,看到细胞的形态变得正常了,免疫途径也得到了恢复。(注:抗生素损伤的小鼠肠道的很多表型和无菌群的小鼠肠道表型相似。)

对于消化道的菌群组的概念是要比病毒组早一些,而且大量的测序工作和分析工作给出了很多有益的信息。这些测序工作得益于高效的测序技术,和很多辛苦工作的研究人员,尤其是华大基因的研究者们。而病毒组的概念也并非很新的概念,早在 2010 年就有报道(Viruses in the faecal microbiota of monozygotic twins and their mothers. Nature 466, 334–338 (15 July 2010))。

生物体并非孤立存在的,而是与其他生物以及环境有着很大关系的。因此,在人及动物的消化道中存在着大量的微生物和病毒也是情理之中的事情。微生物,比如细菌,古菌,真菌,衣原体支原体,甚至有可能有原生动物。病毒的话,可能有植物病毒(我也很奇怪为啥会有植物病毒),动物病毒,真菌病毒,细菌病毒等等。

相对于消化道菌群组,病毒组则更加难以检测和测序。考虑到病毒就遗传物质而言,可以分为 RNA 病毒和 DNA 病毒(朊病毒这里不做讨论),以目前的技术,大规模的 DNA 测序非常成熟了,但是 RNA 测序远没有这么简单。所以,测到的病毒组应该还是以 DNA 病毒为主。能够通过测序信息,来与数据库比对,可以让我们对病毒 - 细菌 - 人之间的关系有进一步的了解,但是想完全厘清三者间的关系则非常复杂。本身来说,这类的“组”都是大量片段化信息的“组合”,不仅会造成一些错误还会丢失不少重要信息。加上,我们对生物间的互作关系了解的非常少,所以这些“组”的信息可以提供一些参考,而非绝对的准确的指导性信息。

这次这个发现,证明了 MNV 可以帮助恢复某些小鼠肠道的功能,很有意义,但是也只是揭开了冰山一角。病毒组的概念并非首次提出和证明,故没有那么大的意义。不过,这起码证明了特殊情况下,病毒 MNV 与宿主小鼠间的关系很复杂,并非简单的有益或者有害,具体如何则涉及到环境和宿主还有其互作的情况。

从理论到深入的理论,再到应用,路还很长很长。我们还在黎明前的黑暗中,未见光明。(以后得靠多少代生物狗啊。)

同时,往往爆出的一些划时代的发现,到后来又销声匿迹了,这也是很值得玩味的事情。

不知道这个研究能有多少发展,能够带来多少研究岗位,是否能够让理论更清晰,应用更实际,我们还要拭目以待。

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