谢邀。病生理当初真是学得不好，只能大抵凭记忆试着简单讲一下，抛砖引玉了，同时诚望勘误。

不少疾病的病情在白天和夜晚确实会有所差异，但未必就是“白天减轻，晚上加重”，也不止是“注意力”的问题那么简单。。

神经内分泌影响，或者说内环境影响。人在睡眠状态下的神经张力以及激素分泌水平与清醒时有所不同，并进一步发展为昼夜节律，也就是生物钟。
人在睡眠时交感神经受抑制，副交感神经兴奋，肾上腺素分泌水平下降，这一系列变化造成了机体的耐受性降低（一定程度上可以理解为抵抗力，但要注意与免疫力区分），使得咳嗽、疼痛、体温升高等症状比起白天更难忍受，是造成许多疾病“夜间加重”的主要原因。
同时，内环境的变化还可能成为一些疾病的诱因，例如夜间体温降低引起支气管收缩，诱发哮喘；又如胰岛素在深夜逐渐升高，引起夜间低血糖，造成休克昏迷。
但之前也说了，规律并不一定是“白天减轻，晚上加重”的。有不少疾病会因为神经反射而在早晨起床后发作，例如由于血液中血小板含量在早晨最高，促进血液凝集形成血栓，因而引发脑卒中；又如晨起时排便反射以及皮质醇激素水平升高，使得肠应激综合征症状加重，引起腹痛、腹胀等症状。

体位影响，这也是一个很重要的因素。由于夜间长时间平躺，机体承受的压力分布与白天工作时的直立体位有诸多不同，从而对体液循环产生了影响。
例如题主提到的牙疼，牙髓炎常在夜间发作的原因就有被认为是因为平躺后头部血供增加、血管搏动增强，从而引发受压迫的牙神经随心跳产生自发性跳痛；平躺时心搏出量降低，也会造成心衰患者平躺无法入睡，严重情况下更会导致猝死。
同样的，平躺后易引起食管内消化液以及炎症产生的肺内积液等反流，刺激溃疡部或气管，从而造成胃痛、咳嗽等症状。
同样的，体位造成的影响也并不一定是“白天减轻，晚上加重”的。如静脉曲张（包括痔疮）、肾下垂等疾病就会因直立体位，脏器承受压力增加、位移扩大，而产生症状“白天工作时加重，夜间平躺时减轻”的现象。

环境因素影响，这里的环境则是指外环境。
昼夜温差、气压差、湿度差，也可引起症状的改变。如夜晚体感温度较低，发烧症状更明显；呼吸衰竭因室内封闭空间经过一夜后湿度降低，脚气、皮炎等症状减轻，咳嗽、小血管破裂出血等症状则可能加重；非封闭空间下湿度升高则反之；夜间气压升高可加重呼吸衰竭。
另一方面，被褥上的螨虫等因素则可能成为诱发哮喘、激发皮炎的过敏原，从而产生夜间症状加重白天减轻的情况；而若过敏原存在于外界或工作坏境，如油漆、花粉等，表现得自然就是白天症状加重、夜间减轻了；肾结石内细菌活动期在晚上，则是夜间肾疼加剧的原因之一。

活动性影响，人在昼夜间活动量差异也可造成的症状变化。
例如夜间食物摄入减少，胃酸开始过度消化自身组织，加重消化道溃疡的胃痛、嗳气等症状；饮水频率降低使得排尿减少则可造成钾、钠及一些激素积留增加，而加重晨间的痛风、孕吐等症状。
夜间活动减少还会引起诸多体内物质，例如关节部位长时间不活动，分泌物潴留，使得关节炎的僵硬疼痛症状夜间加重；睡眠中长时间维持不当姿势造成脊柱劳损，使得在白天发生落枕、背痛等症状；肌损、骨折等则在白天活动时疼痛加重，夜间静卧后缓解。
活动性的差异还影响了用药时间。晨服和夜服的药物会依据各自特性在不同时间发挥效用，影响症状的强弱。

心理因素影响，人在不同时间段里可能产生不同的心理变化，这个因素的影响力可大可小。
心理影响的个体差异较大，所以很难做广泛的讨论，只提一个比较普遍的例子。抑郁症的症状会在夜晚减轻而在白天加重，一般认为是由于患者晨时对“新的一天”产生焦虑，而在夜间对于“一天已经过去了”而产生放松感。
大家讨论的“注意力”问题或许也可划分到心理因素里。

综上，疾病的昼夜差异牵涉到诸多复杂的生理病理变化，学界现在也并不能十分清晰、准确的阐释原因，但确实有很多值得讨论的地方，为缓解患者痛苦提供帮助。

————附：
我在稍微斟酌了一下后选了比较平实的叙述方式以求严谨，但也确实自觉文中不少地方对于非医学专业的朋友可能不太好懂，所以欢迎大家给我反馈，提出不太理解的地方，我会尽量给予解释的～